Trường THCS Phan Văn Trị được thành lập theo Quyết định số 3270 QĐ-UBND ngày 26/5/2016 của Ủy ban Nhân dân Quận Gò Vấp, tại địa chỉ 468/2/2 đường Phan Văn Trị - Phường 07 - Quận Gò Vấp, TP.Hồ Chí Minh.
Năm học 2016-2017 trường được Sở GD-ĐT chọn mô hình giảng dạy theo Đề án “Dạy và học các môn Toán, Khoa học, Tiếng Anh tích hợp Chương trình Anh và Việt Nam”;
Năm học 2017-2018 trường được UBND TP phê duyệt xây dựng Trường tiên tiến, theo xu thế hội nhập khu vực và quốc tế tại Thành phố Hồ Chí Minh.